エンジェル税制とは？優遇措置5種類・節税シミュレーション・最新改正を徹底解説【2025年最新】

「エンジェル税制」という言葉を聞いたことはあるものの、具体的にどのような制度なのか、自分にも活用できるのかわからないという方は多いのではないでしょうか。

エンジェル税制とは、 スタートアップ企業に投資した個人投資家が所得税の優遇措置を受けられる制度 です。投資時と株式売却時の2回にわたって税制上のメリットがあり、投資をしながら節税も実現できる注目の制度です。

エンジェル税制とは？制度の概要と歴史

エンジェル税制の定義

エンジェル税制とは、 ベンチャー企業（スタートアップ）に投資を行った個人投資家に対して、 所得税の優遇措置を提供する制度 です 。正式名称は「特定中小会社が発行した株式の取得に要した金額の控除等」といいます。

「エンジェル」とは、創業間もない企業に資金を提供する個人投資家のことを指します。エンジェル税制は、こうした個人投資家のリスクの高い投資行動を税制面から後押しし、日本のスタートアップエコシステムの活性化を目指しています。

この制度の最大の特徴は、「投資時」と「株式売却時」の2つのタイミングで税制優遇を受けられる点にあります。

制度創設の背景と目的

エンジェル税制は 1997年（平成9年） に創設されました 。当時、日本はバブル崩壊後の長期不況の中にあり、新しい産業やイノベーションの創出が急務とされていました。

しかし、日本のエンジェル投資額は米国と比較して極めて低い水準にあります。米国ではエンジェル投資の年間総額が数兆円規模であるのに対し、日本は数百億円程度にとどまっています。

日本の開業率は5.1%で、米国（9.3%）やフランス（12.0%）と比較して低水準にとどまっている。スタートアップへの投資を促進するため、エンジェル税制の拡充を図る。

出典： 経済産業省「エンジェル税制」

こうした状況を打破するため、政府は段階的にエンジェル税制を拡充し、個人投資家がスタートアップに投資しやすい環境整備を進めてきました。

日本のエンジェル投資の現状

近年、日本でもスタートアップ投資への関心が高まっています 。政府は2022年に「スタートアップ育成5か年計画」を策定し、 2027年度までにスタートアップへの投資額を10兆円規模に拡大する 目標を掲げています。

エンジェル税制の利用件数も年々増加傾向にあり、特に株式投資型クラウドファンディング（ECF）の普及に伴い、少額からエンジェル投資に参加する個人投資家が増えています。

エンジェル税制の優遇措置5種類【一覧表付き】

エンジェル税制には、投資時に受けられる優遇措置が5種類あります。それぞれ対象企業の条件や控除方法が異なるため、自分の状況に合った措置を選択することが重要です。

優遇措置A（所得控除）

優遇措置Aは、 設立3年未満のベンチャー企業 への投資が対象です 。投資額から2,000円を差し引いた金額が、その年の総所得金額等から控除されます。

優遇措置Aは所得控除であるため、所得税率が高い高所得者ほど節税効果が大きくなるという特徴があります。

優遇措置A-2（所得控除の特例）

優遇措置A-2は、 設立5年未満の特定のベンチャー企業 への投資が対象です 。優遇措置Aと同じく所得控除ですが、対象企業の範囲がやや広くなっています。

具体的には、設立3年以上5年未満で、売上高が一定の成長率を満たす企業が対象となります。

優遇措置B（株式譲渡益の控除）

優遇措置Bは、 設立10年未満のベンチャー企業 への投資が対象です 。投資額全額をその年の株式等の譲渡益から控除できます。

優遇措置Bは株式の売却益がある年に特に有効です。他の株式で得た利益を実質的に非課税にできるため、アクティブに株式投資を行っている投資家に向いています。

プレシード・シード特例（非課税措置）

2023年4月に導入されたプレシード・シード特例は、 エンジェル税制の中でも 最も強力な優遇措置 です 。設立5年未満の非常に初期段階のスタートアップへの投資が対象で、 投資額の上限20億円まで非課税 となります。

この特例は、起業家自身が自己資金で起業する場合にも適用されるのが大きなポイントです。

株式売却時の優遇措置

エンジェル税制では、 投資時だけでなく 株式の売却時にも優遇措置 があります 。投資先企業の株式を売却して損失が発生した場合、その年の他の株式譲渡益と通算でき、さらに 通算しきれない損失は翌年以降3年間にわたって繰越控除 できます。

なお、この損失の繰越控除を利用する場合、投資時に受けた優遇措置の控除額分だけ取得価額が引き下げられる点に注意が必要です。

【比較表】優遇措置5種類の違い

名称ではなく要件と税務効果の違いで区分することが重要です

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【年収別シミュレーション】エンジェル税制でいくら節税できる？

エンジェル税制でどれくらい節税できるのかは、投資家の年収や投資額、選択する優遇措置によって異なります。ここでは 優遇措置Aを利用した場合の具体的な節税額 をシミュレーションします。

年収700万円のケース

要件・証拠・資金繰りを一体で確認することが重要です

年収1,000万円のケース

要件・証拠・資金繰りを一体で確認することが重要です

年収2,000万円のケース

要件・証拠・資金繰りを一体で確認することが重要です

このように、 年収が高いほど適用税率が上がるため、節税効果も大きくなる のがエンジェル税制（優遇措置A）の特徴です。ただし、あくまで投資したお金が全額戻るわけではない点に注意しましょう。

【令和7年度改正】2025年・2026年の最新変更ポイント

エンジェル税制は、スタートアップ投資を促進するために毎年のように改正が行われています。ここでは、令和6年度・令和7年度の最新改正ポイントを解説します。

再投資期間の延長（最大2年間）

令和7年度改正の最大の目玉は、 再投資期間の延長 です 。従来、優遇措置Bやプレシード・シード特例で株式譲渡益を控除するには、譲渡益が発生した 同一年内 に再投資する必要がありました。

改正後は、株式譲渡益が発生した年の翌年末まで（最大2年間）に再投資すれば控除が適用されます。この変更により、投資先の選定に十分な時間をかけられるようになりました。

繰戻し還付制度の創設

令和7年度改正では、 新たに 繰戻し還付制度 が創設されました 。これにより、過去に株式譲渡益に対して支払った税金について、一定の条件を満たせば 還付（返金）を受けられる ようになりました。

従来は「控除しきれなかった投資額は切り捨て」でしたが、この改正により活用の幅が大きく広がっています。

令和6年度改正：新株予約権・信託投資の対象化

令和6年度の税制改正では、 以下の2点が拡充されました 。

①新株予約権の取得金額も対象に
従来は株式の取得に限られていた控除対象が、有償新株予約権（ストック・オプション等）の取得金額にも拡大されました。

②信託を通じた投資も対象に
信託契約を通じてベンチャー企業に投資した場合も、エンジェル税制の対象となりました。これにより、より多様な投資スキームでの活用が可能になっています。

エンジェル税制の対象要件【投資家・企業別】

エンジェル税制の優遇措置を受けるには、個人投資家と対象企業の双方が一定の要件を満たす必要があります。

個人投資家の要件

個人投資家が 満たすべき要件は以下のとおりです 。

重要なのは、金銭の払込みによる新規株式の取得が必須条件である点です。既存株式を他の株主から購入した場合は対象外となります。

対象企業の要件（優遇措置A・B共通）

対象者・金額・期限を一次資料で確認することが重要です

優遇措置A固有の企業要件

優遇措置Aの適用を受けるには、 上記の共通要件に加えて以下の条件を満たす必要があります 。

・設立3年未満であること
・研究者あるいは新規事業活動従事者が2人以上で、かつ常勤従業員の10%以上であること（設立1年未満の場合）
・売上高に占める試験研究費等の割合が一定以上であること

優遇措置B固有の企業要件

優遇措置Bの適用には、 以下の条件を追加で満たす必要があります 。

・設立10年未満であること
・売上高に占める試験研究費等の割合が一定以上であること、または売上高成長率が一定以上であること

エンジェル税制の対象企業となるためには、都道府県知事への確認申請が必要です。事前確認制度を利用することで、投資家に対して「エンジェル税制適用企業」としてアピールすることができます。

出典： 中小企業庁「エンジェル税制の対象要件」

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投資方法3つの比較【直接投資・LPS・ECF】

エンジェル税制の対象となる投資を行う方法は、大きく分けて3つあります。それぞれの特徴とメリット・デメリットを比較します。

直接投資

直接投資とは、 投資家がスタートアップ企業に対して直接出資する方法です 。投資先企業との距離が近く、経営への関与も可能ですが、自分で投資先を見つける必要があります。

LPS（投資事業有限責任組合）経由

LPS（投資事業有限責任 組合）を通じて間接的にスタートアップに投資する方法です 。ファンドマネージャーが投資先を選定してくれるため、専門知識がなくても投資できますが、最低出資額が高めに設定されていることが多いです。

ECF（株式投資型クラウドファンディング）

ECF（Equity Crowdfunding）は、 インターネット上のプラットフォームを通じてスタートアップに投資する方法です 。少額（10万円程度〜）から投資できる のが最大の特徴で、個人投資家にとって最もハードルが低い方法です。

エンジェル税制のメリット・デメリット

エンジェル税制には、個人投資家とスタートアップ企業の双方にメリット・デメリットがあります。投資判断の前に、両面をしっかり理解しておきましょう。

個人投資家のメリット

①投資と節税を同時に実現できる エンジェル税制の最大のメリットは、 スタートアップへの投資を通じて 所得税の軽減 ができる点です 。投資額に応じて所得控除や譲渡益控除が受けられるため、「投資しながら節税」という一石二鳥の効果があります。

②投資先が成功すれば大きなリターンが期待できる
スタートアップがIPO（上場）やM&A（企業買収）を達成した場合、投資額の数十倍〜数百倍のリターンを得られる可能性があります。

③売却損も税制上有利に処理できる
投資先企業が残念ながら失敗した場合でも、売却損を他の株式譲渡益と通算でき、さらに3年間の繰越控除が可能です。

個人投資家のデメリット

①実質的には「課税の繰延」である側面がある 優遇措置AやBで受けた控除は、将来の株式売却時に取得価額が引き下げられるため、 最終的な譲渡益に課税される ケースがあります 。完全な「節税」ではなく「課税の繰延」という側面を持つ点に注意が必要です。

②スタートアップ投資のリスクが高い
スタートアップ企業の多くは事業に失敗します。投資した資金が全額失われるリスクがあり、税制優遇を受けたとしても投資リスク自体は軽減されません。

③確定申告の手続きが煩雑
エンジェル税制の適用を受けるためには、通常の確定申告に加えて特別な書類の準備が必要です。特に初めて利用する場合は、手続きに慣れるまで時間がかかります。

④流動性が低い
未上場株式は上場株式と異なり、いつでも自由に売買できるわけではありません。投資した資金が長期間拘束される可能性があります。

スタートアップ企業のメリット

①投資を受けやすくなる エンジェル税制の適用企業として認定されると、投資家にとって税制面のメリットがあるため、 投資を集めやすくなります 。

②返済義務のない資金を調達できる
銀行融資と異なり、エンジェル投資家からの出資金には返済義務がありません。

③対外的な信用力が向上する
経済産業省のHPにエンジェル税制適用企業として社名が公表されるため、企業の信用力向上につながります。

スタートアップ企業のデメリット

①確認申請の手続きが必要 都道府県知事への確認申請が必要で、 申請手続きに一定の事務負担が生じます 。

②対象要件を外れるリスクがある
設立年数の経過や外部資本比率の低下により、エンジェル税制の対象から外れる可能性があります。

申請から確定申告までの手続きフロー

エンジェル税制を利用するための手続きは、スタートアップ企業側と個人投資家側の両方で必要です。

スタートアップ企業側の手続き（4ステップ）

要件・証拠・資金繰りを一体で確認することが重要です

個人投資家側の手続き（3ステップ）

要件・証拠・資金繰りを一体で確認することが重要です

確定申告で必要な書類

確定申告で必要な書類は、 選択する優遇措置によって異なります 。

エンジェル税制を適用して確定申告する場合、投資した年分の確定申告書に一定の書類を添付して申告する必要があります。確定申告の期限は、投資した年の翌年2月16日から3月15日までです。

出典： 国税庁「No.1544 エンジェル税制の概要等」

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NISA・iDeCoとの違い【他の税制優遇制度との比較】

節税効果のある投資制度としては、エンジェル税制以外にもNISAやiDeCoなどがあります。それぞれの違いを理解して、自分に合った制度を選択しましょう。

NISAとの違い

NISAは 上場株式や投資信託の配当・売却益が非課税になる制度です 。エンジェル税制が未上場のスタートアップへの投資を対象にしているのに対し、NISAは 上場企業の株式等が対象 となります。

iDeCoとの違い

iDeCo（個人型確定拠出年金）は、掛金が全額所得控除になる点ではエンジェル税制の優遇措置Aと似ていますが、 原則60歳まで引き出せない という制約があります 。

ふるさと納税との違い

ふるさと納税は寄附金控除の一種で、 自己負担2,000円で返礼品が受け取れる制度です 。エンジェル税制とは仕組みが大きく異なりますが、 併用が可能 です。

【比較表】主要な税制優遇制度

名称ではなく要件と税務効果の違いで区分することが重要です

エンジェル税制は他の制度と比べてリスクが高いものの、 投資先が成功した場合のリターンは圧倒的に大きい という特徴があります。分散投資の一環として、資産の一部をエンジェル投資に振り向ける戦略が有効です。

エンジェル税制に関するよくある質問