会社売却でかかる税金｜株式譲渡の手取り計算と注意点
オーナーが会社を株式譲渡で売却する場合、売却価格から株式の取得費と譲渡費用を差し引いて税金を計算します。役員退職金や事業譲渡との違いも、最終手取りで比較します。
株式譲渡は株主、事業譲渡は会社が対価を受け取るため、税金と資金の帰属が異なります。
この記事は、個人オーナーが非上場会社を株式譲渡で売るケースが中心です。株式譲渡益は『売却代金－取得費－譲渡費用』で、基本税率は20.315％です。
個人オーナーの株式譲渡を中心に、取得費、M&A報酬、役員退職金、契約上の留保を手取りへ反映します。 制度の適用は取引条件で変わるため、契約前と申告前に税理士等へ確認してください。
- 株主別の株式取得費資料
- 株価算定書と契約上の価格調整条項
- 仲介・FA・弁護士・税理士の契約書
- 会社と株主それぞれの入出金予定
- 会社売却の方法で納税者が変わる
- 個人株主の株式譲渡益を計算する
- 創業株式の取得費資料を集める
- M&A報酬のうち譲渡費用を判定する
会社売却の方法で納税者が変わる
株式譲渡は株主、事業譲渡は会社が対価を受け取るため、税金と資金の帰属が異なります。
確認ポイント：会社売却という言葉だけで税率を決めない
『会社売却の方法で納税者が変わる』は、契約書や明細に書かれた事実から判定します。 会社売却という言葉だけで税率を決めない
この論点では『会社売却という言葉だけで税率を決めない』ことが重要です。会社売却手取り比較表には、採用した金額と根拠資料を並べ、個人株主、対象会社、買主、M&A支援者、税理士に関する入出金や税額を当事者別に記載します。
スキーム別に株主・会社・買主の資金表を作ります
スキーム別に株主・会社・買主の資金表を作ります。 会社売却手取り比較表では確定額と未確定額を分けて管理する
確認結果は会社売却手取り比較表へ反映し、クロージング後の申告までに条件が変わった場合は『会社売却の方法で納税者が変わる』の数字も更新します。
中小M&Aでは、支援業務の範囲、手数料、利益相反への対応を契約前に確認し、税理士や弁護士などの専門家と連携することが重要です。
個人株主の株式譲渡益を計算する
譲渡価額から株式取得費と譲渡費用を差し引き、一般株式等の譲渡所得等として計算します。
確認ポイント：会社の簿価を株主の取得費にしない
『個人株主の株式譲渡益を計算する』は、契約書や明細に書かれた事実から判定します。 会社の簿価を株主の取得費にしない
この論点では『会社の簿価を株主の取得費にしない』ことが重要です。会社売却手取り比較表には、採用した金額と根拠資料を並べ、個人株主、対象会社、買主、M&A支援者、税理士に関する入出金や税額を当事者別に記載します。
株主ごとに売却代金と費用を配賦します
株主ごとに売却代金と費用を配賦します。 会社売却手取り比較表では確定額と未確定額を分けて管理する
確認結果は会社売却手取り比較表へ反映し、クロージング後の申告までに条件が変わった場合は『個人株主の株式譲渡益を計算する』の数字も更新します。
個人が一般株式等を譲渡した利益は、譲渡価額から取得費と売却手数料等を差し引き、他の所得と区分して計算します。
創業株式の取得費資料を集める
設立時の払込、増資、相続・贈与、株式移動の履歴が取得費へ影響します。
確認ポイント：現在の資本金をそのまま個人取得費にしない
『創業株式の取得費資料を集める』は、契約書や明細に書かれた事実から判定します。 現在の資本金をそのまま個人取得費にしない
この論点では『現在の資本金をそのまま個人取得費にしない』ことが重要です。会社売却手取り比較表には、採用した金額と根拠資料を並べ、個人株主、対象会社、買主、M&A支援者、税理士に関する入出金や税額を当事者別に記載します。
通帳、申告書、株主名簿、議事録を確認します
通帳、申告書、株主名簿、議事録を確認します。 会社売却手取り比較表では確定額と未確定額を分けて管理する
確認結果は会社売却手取り比較表へ反映し、クロージング後の申告までに条件が変わった場合は『創業株式の取得費資料を集める』の数字も更新します。
株式の取得費には払込代金、購入代金、購入手数料などが含まれます。取得費が分からない場合は売却代金の5％相当額を使う取扱いもあります。
M&A報酬のうち譲渡費用を判定する
仲介・FA・弁護士・税理士報酬は業務内容と負担者により扱いが変わります。
確認ポイント：会社払いなら全て個人の譲渡費用になると考えない
『M&A報酬のうち譲渡費用を判定する』は、契約書や明細に書かれた事実から判定します。 会社払いなら全て個人の譲渡費用になると考えない
この論点では『会社払いなら全て個人の譲渡費用になると考えない』ことが重要です。会社売却手取り比較表には、採用した金額と根拠資料を並べ、個人株主、対象会社、買主、M&A支援者、税理士に関する入出金や税額を当事者別に記載します。
契約書と請求内訳を株主・会社で分けます
契約書と請求内訳を株主・会社で分けます。 会社売却手取り比較表では確定額と未確定額を分けて管理する
確認結果は会社売却手取り比較表へ反映し、クロージング後の申告までに条件が変わった場合は『M&A報酬のうち譲渡費用を判定する』の数字も更新します。
中小M&Aでは、支援業務の範囲、手数料、利益相反への対応を契約前に確認し、税理士や弁護士などの専門家と連携することが重要です。
役員退職金は売却価格と合わせて比較する
退職金は個人課税だけでなく会社の損金、現金、株式価値、買主負担へ影響します。
確認ポイント：個人の税率差だけで金額を決めない
『役員退職金は売却価格と合わせて比較する』は、契約書や明細に書かれた事実から判定します。 個人の税率差だけで金額を決めない
この論点では『個人の税率差だけで金額を決めない』ことが重要です。会社売却手取り比較表には、採用した金額と根拠資料を並べ、個人株主、対象会社、買主、M&A支援者、税理士に関する入出金や税額を当事者別に記載します。
退職金あり・なしを同じ総買収コストで比べます
退職金あり・なしを同じ総買収コストで比べます。 会社売却手取り比較表では確定額と未確定額を分けて管理する
確認結果は会社売却手取り比較表へ反映し、クロージング後の申告までに条件が変わった場合は『役員退職金は売却価格と合わせて比較する』の数字も更新します。
退職所得は原則として他の所得と分離して計算します。役員退職金を含め、受給者側の課税と会社側の損金算入要件は分けて確認します。
契約条項が売却後の手取りを左右する
価格調整、表明保証、補償、エスクローは受取時期や返還リスクへ影響します。
確認ポイント：契約時価格を全額確定入金とみなさない
『契約条項が売却後の手取りを左右する』は、契約書や明細に書かれた事実から判定します。 契約時価格を全額確定入金とみなさない
この論点では『契約時価格を全額確定入金とみなさない』ことが重要です。会社売却手取り比較表には、採用した金額と根拠資料を並べ、個人株主、対象会社、買主、M&A支援者、税理士に関する入出金や税額を当事者別に記載します。
税額と留保金を分けた資金計画を作ります
税額と留保金を分けた資金計画を作ります。 会社売却手取り比較表では確定額と未確定額を分けて管理する
確認結果は会社売却手取り比較表へ反映し、クロージング後の申告までに条件が変わった場合は『契約条項が売却後の手取りを左右する』の数字も更新します。
中小M&Aでは、支援業務の範囲、手数料、利益相反への対応を契約前に確認し、税理士や弁護士などの専門家と連携することが重要です。
申告資料はクロージング時に固める
最終株価、費用、入金、株式移転日を確定し、株主別の計算資料を保存します。
確認ポイント：M&A完了後に取得費調査を始めない
『申告資料はクロージング時に固める』は、契約書や明細に書かれた事実から判定します。 M&A完了後に取得費調査を始めない
この論点では『M&A完了後に取得費調査を始めない』ことが重要です。会社売却手取り比較表には、採用した金額と根拠資料を並べ、個人株主、対象会社、買主、M&A支援者、税理士に関する入出金や税額を当事者別に記載します。
翌年の申告担当と資料期限を決めます
翌年の申告担当と資料期限を決めます。 会社売却手取り比較表では確定額と未確定額を分けて管理する
確認結果は会社売却手取り比較表へ反映し、クロージング後の申告までに条件が変わった場合は『申告資料はクロージング時に固める』の数字も更新します。
個人が一般株式等を譲渡した利益は、譲渡価額から取得費と売却手数料等を差し引き、他の所得と区分して計算します。
手取りは税金・費用・留保を引いて判断する
売却価格ではなく、税金、専門家報酬、返済、エスクロー等を控除した利用可能額を確認します。
確認ポイント：最高提示価格だけで買主を選ばない
『手取りは税金・費用・留保を引いて判断する』は、契約書や明細に書かれた事実から判定します。 最高提示価格だけで買主を選ばない
この論点では『最高提示価格だけで買主を選ばない』ことが重要です。会社売却手取り比較表には、採用した金額と根拠資料を並べ、個人株主、対象会社、買主、M&A支援者、税理士に関する入出金や税額を当事者別に記載します。
標準・補償発生・価格調整の三案を作ります
標準・補償発生・価格調整の三案を作ります。 会社売却手取り比較表では確定額と未確定額を分けて管理する
確認結果は会社売却手取り比較表へ反映し、クロージング後の申告までに条件が変わった場合は『手取りは税金・費用・留保を引いて判断する』の数字も更新します。
個人が一般株式等を譲渡した利益は、譲渡価額から取得費と売却手数料等を差し引き、他の所得と区分して計算します。
株式譲渡による会社売却の税金についてよくある質問
会社売却の税率は一律ですか
売却方法と売主が個人か法人かで異なります。個人株主の株式譲渡は一般株式等として計算します。
資本金は株式の取得費ですか
常に一致するわけではありません。株主本人の払込や取得履歴を資料で確認します。
M&A仲介手数料は差し引けますか
業務内容、契約者、支払者を基に譲渡費用該当性を確認します。
役員退職金を出すと必ず有利ですか
株価、会社の損金、買主負担、適正額を合わせて比較する必要があります。
